某市一高檔住宅小區(qū)，2000年業(yè)主在購買商品房時，都同時購買了一間地下室，辦理了房屋產權證后，部分住戶到當?shù)貒临Y源局申請辦理《國有土地使用證》時，被告知地下室不能頒發(fā)《國有土地使用證》。一些業(yè)主對此提出疑問，當?shù)貒临Y源局沒有給予合理解釋，但該國土資源局已給該小區(qū)部分住戶的地下室發(fā)放了《國有土地使用證》。未能辦理地下室的《國有土地使用證》的住戶不服，要求國土資源局給出明確理由，否則將以行政不作為為由提起行政復議或者行政訴訟。

該國土資源局經認真研究，并向上級部門請示咨詢后，給該小區(qū)的住戶發(fā)放了地下室的《國有土地使用證》。

關于地下室能否登記發(fā)證的問題，目前我國的法律法規(guī)還沒有明確的規(guī)定。但是，各地在實踐中已經進行了積極的探索，有的對方進行了登記發(fā)證。在實踐中，一般根據(jù)的是國土資源部2000年8月15日給廣東省國土資源廳《關于地下建筑物土地確權登記有關問題的復函》(國土資廳函[2000]171號]，其中規(guī)定：“1、凡是與地上建筑物連為一體的地下建筑物，其土地權利可以確定為國有土地使用權。具體登記時，將地下建筑物的建筑面積計入整體建筑總面積，然后按權利人擁有的地下建筑面積占整體建筑面積的比例分攤地面上的土地面積。2、離開地面一定深度單獨建造，不能與地上建筑物連為一體的地下建筑物，其土地權利可確定為國有土地使用權(地下)。具體登記時，其土地面積為地下建筑物垂直投影面積，并在備注欄說明相應地上國有土地使用權的特征。國有土地使用權(地下)在不違反地下建筑物規(guī)定的用途、使用條件的前提下，可以進行出租、轉讓和抵押。”

另外，北京市國土資源局于2005年3月30日發(fā)布的(關于在京中央國家機關住宅用地土地登記的處理意見)第3條以及重慶市國土房管局2004年11月發(fā)布的《重慶市土地房屋權屬登記操作規(guī)程(試行)》第7條均按照國土資源部的復函內容對地下建筑物進行了規(guī)定。從實際需要分析，該國土資源局給住戶的地下室進行土地登記發(fā)證是可行的。

《物權法》頒布以后，建設用地使用權可以分層設立，這樣就可以很好地解決如上所述的一些爭議和矛盾。